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115分科測驗生物 第12題 詳解

古 DNA・PCR定種 · 單選 · 題目出處:115 學年度分科測驗 生物考科(大學入學考試中心)

題目
考古研究發現 14,000 年前的麵包硬到難以入口,羅馬時代的人會將啤酒泡沫混入麵糰,讓麵包變得蓬鬆好吃,後來瞭解是啤酒泡沫中酵母菌的作用。下列哪種生物技術可以協助科學家在考古過程中,解析出具百年歷史的窯烤麵包中所含的酵母菌種類?
(A) 萃取出麵包中的酵母菌 DNA,再轉殖入小鼠胚胎細胞中,測量細胞的 CO2\mathrm{CO_2} 生成量
(B) 萃取出麵包中含有的 DNA,利用酵母菌 DNA 的專一性引子進行 PCR,再分析所得 DNA 的序列
(C) 將麵包中的酵母菌重新培養,利用顯微鏡進行酵母菌染色體核型分析,觀測染色體數量與特色
(D) 將麵包中的酵母菌重新培養,再以農桿菌轉殖法轉殖入植物組織,觀測植物所呈現的生理變化

答案(B) 萃取出麵包中含有的 DNA,利用酵母菌 DNA 的專一性引子進行 PCR,再分析所得 DNA 的序列看逐步解析 ↓

逐步解析

  1. 1

    先確認樣本狀態

    百年的窯烤麵包經歷過高溫烘焙與長期存放,裡面的酵母菌早就死透了,只剩下被降解成短片段、含量極低的古 DNA,而且混雜著小麥、汙染細菌甚至經手者的 DNA。這一步決定了整題的方向:凡是需要「活菌」的做法一開始就出局,可行的路徑只能從殘存的 DNA 下手。
  2. 2

    PCR 同時解決兩個難題

    把麵包中的總 DNA 萃取出來後,用酵母菌基因組上專一的引子進行 PCR,例如針對核糖體 RNA 基因之間的 ITS 區設計引子。專一性引子只與酵母菌的序列互補,能在一團混雜的 DNA 中選擇性擴增目標片段,順便解決「量太少」與「太混雜」這兩個難題;把擴增產物定序,再與資料庫比對,就能判定是哪一種或哪幾種酵母菌。這正是 (B) 的流程。
  3. 3

    另外三項錯在哪

    (A) 把 DNA 轉殖入小鼠胚胎細胞,哺乳類細胞不會正確表現酵母菌的基因;而且 CO2\mathrm{CO_2} 生成量只是代謝速率的指標,各種酵母菌都會產生 CO2\mathrm{CO_2},量的多寡完全無法用來鑑別物種。(C) 的前提「重新培養」不成立,死菌無法復育;退一步說,釀酒酵母有 16 條染色體且每一條都極小,光學顯微鏡下的核型分析解析度遠遠不足以區分近緣的酵母菌種。(D) 同樣要有活菌,且農桿菌轉殖是把 T-DNA 送進植物細胞的技術,觀察植物的生理變化與判定酵母菌的種類之間毫無因果關聯。
  4. 4

    結論

    答案選 (B)。誘答冠軍是 (C):染色體核型分析在課本裡確實是「判別物種與染色體異常」的工具,看到熟悉的技術就容易勾選,卻忽略它的兩個前提——必須有活的分裂中細胞,而且染色體要夠大、帶紋要夠清楚。考古樣本兩個條件都不符合。凡是題目出現古老、化石、遺骸這類字眼,鑑定物種的標準答案幾乎一定是萃取 DNA 加上 PCR 擴增後定序。
答案
(B) 萃取出麵包中含有的 DNA,利用酵母菌 DNA 的專一性引子進行 PCR,再分析所得 DNA 的序列

關鍵觀念:#DNA定序 #PCR #古生物技術

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常見卡點
這題失分的根源是沒有先判斷「樣本裡的生物還活著嗎」。考古或化石樣本一律預設只剩降解的 DNA,凡是寫著「重新培養」「觀察活菌生理反應」的選項可以直接刪除,四選一瞬間變二選一。剩下的再比哪一個能處理「量少又混雜」的難題——答案永遠是專一性引子加 PCR 再定序,這是古 DNA 研究的標準流程。

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